Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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