Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATMQ13315 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATMQ13315 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATMQ13315 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATMQ13315 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATMQ13315 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATMQ13315 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATMQ13315 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATMQ13315 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATMQ13315 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATMQ13315 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATMQ13315 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATMQ13315 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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