Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
DUSP4Q13115 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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