Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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