Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BNIP3Q12983 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BNIP3Q12983 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BNIP3Q12983 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BNIP3Q12983 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BNIP3Q12983 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BNIP3Q12983 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BNIP3Q12983 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BNIP3Q12983 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BNIP3Q12983 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BNIP3Q12983 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BNIP3Q12983 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BNIP3Q12983 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BNIP3Q12983 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms