Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMARCB1Q12824 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMARCB1Q12824 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMARCB1Q12824 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMARCB1Q12824 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMARCB1Q12824 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMARCB1Q12824 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMARCB1Q12824 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMARCB1Q12824 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMARCB1Q12824 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMARCB1Q12824 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMARCB1Q12824 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMARCB1Q12824 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMARCB1Q12824 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMARCB1Q12824 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMARCB1Q12824 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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