Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
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CENPFP49454 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPFP49454 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPFP49454 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPFP49454 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
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CENPFP49454 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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CENPFP49454 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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CENPFP49454 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPFP49454 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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CENPFP49454 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CENPFP49454 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
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CENPFP49454 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
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CENPFP49454 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CENPFP49454 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CENPFP49454 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CENPFP49454 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC-0.67□□□□□ -2.52
CENPFP49454 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CENPFP49454 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CENPFP49454 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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CENPFP49454 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
CENPFP49454 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CENPFP49454 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CENPFP49454 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CENPFP49454 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CENPFP49454 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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