Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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HOXD10P28358 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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HOXD10P28358 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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HOXD10P28358 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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