Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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