Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SCN8AQ9UQD0 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN8AQ9UQD0 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN8AQ9UQD0 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN8AQ9UQD0 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN8AQ9UQD0 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN8AQ9UQD0 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN8AQ9UQD0 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN8AQ9UQD0 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN8AQ9UQD0 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN8AQ9UQD0 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN8AQ9UQD0 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN8AQ9UQD0 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN8AQ9UQD0 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN8AQ9UQD0 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN8AQ9UQD0 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN8AQ9UQD0 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
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