Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.24□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.24□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms