Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TMOD3Q9NYL9 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TMOD3Q9NYL9 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.4 ms