Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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HOXD1Q9GZZ0 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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HOXD1Q9GZZ0 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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HOXD1Q9GZZ0 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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HOXD1Q9GZZ0 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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HOXD1Q9GZZ0 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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