Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRERF1Q96PN7 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms