Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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GTF3C6Q969F1 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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GTF3C6Q969F1 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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GTF3C6Q969F1 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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GTF3C6Q969F1 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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GTF3C6Q969F1 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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GTF3C6Q969F1 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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GTF3C6Q969F1 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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GTF3C6Q969F1 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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GTF3C6Q969F1 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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GTF3C6Q969F1 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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GTF3C6Q969F1 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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GTF3C6Q969F1 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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GTF3C6Q969F1 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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