Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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USP43Q70EL4 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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USP43Q70EL4 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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USP43Q70EL4 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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USP43Q70EL4 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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