Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM43BQ6ZT52 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM43BQ6ZT52 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM43BQ6ZT52 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
FAM43BQ6ZT52 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
FAM43BQ6ZT52 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
FAM43BQ6ZT52 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM43BQ6ZT52 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms