Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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RTL8BQ17RB0 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
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RTL8BQ17RB0 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
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RTL8BQ17RB0 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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RTL8BQ17RB0 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
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RTL8BQ17RB0 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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RTL8BQ17RB0 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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RTL8BQ17RB0 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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