Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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