Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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