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| PTPN21 | Q16825 | AC244517.12-201 | ENST00000623581 | 663 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC091903.1-201 | ENST00000624322 | 454 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| PTPN21 | Q16825 | CPD-202 | ENST00000543464 | 4007 nt | TSL 2 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| PTPN21 | Q16825 | EPS15-202 | ENST00000371730 | 4736 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | AC138627.2-201 | ENST00000624202 | 601 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SLC39A10-202 | ENST00000409086 | 5432 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | MTND4P29-201 | ENST00000503122 | 1372 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-527P-201 | ENST00000363425 | 104 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-336P-201 | ENST00000364891 | 107 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-805P-201 | ENST00000365643 | 106 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-748P-201 | ENST00000384648 | 107 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL357075.1-201 | ENST00000404107 | 726 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU4-47P-201 | ENST00000410876 | 114 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL591043.1-201 | ENST00000432461 | 424 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | RPS27P29-201 | ENST00000463110 | 252 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL627309.4-201 | ENST00000496488 | 457 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR5047-201 | ENST00000579212 | 100 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC096708.3-201 | ENST00000584226 | 559 nt | TSL 2 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | BX546450.2-201 | ENST00000602419 | 435 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL391813.1-201 | ENST00000603098 | 260 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL033523.1-201 | ENST00000605153 | 153 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | LINC02112-205 | ENST00000606744 | 236 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | ADARB1-213 | ENST00000611195 | 159 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR6128-201 | ENST00000615528 | 109 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | ARHGAP5-202 | ENST00000345122 | 9604 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | TAS2R13-201 | ENST00000390677 | 1637 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | TDRD15-201 | ENST00000405799 | 6135 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | C6orf10-202 | ENST00000375015 | 2173 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | NBEAL1-203 | ENST00000449802 | 10938 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | U3.6-201 | ENST00000363622 | 211 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-1027P-201 | ENST00000383998 | 107 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-843P-201 | ENST00000384454 | 104 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL138885.1-201 | ENST00000405921 | 675 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-325P-201 | ENST00000411132 | 105 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |