Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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