Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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