| CCDC6 | Q16204 | RNU6-1092P-201 | ENST00000516955 | 87 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-56P-201 | ENST00000516986 | 93 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC060765.1-201 | ENST00000522776 | 544 nt | TSL 4 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MTND4P7-201 | ENST00000523876 | 130 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RGS4-209 | ENST00000531057 | 544 nt | TSL 4 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MDM2-233 | ENST00000545204 | 398 nt | TSL 5 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL132780.1-202 | ENST00000548322 | 591 nt | TSL 4 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | IGKV1-33-202 | ENST00000558152 | 324 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC005357.2-201 | ENST00000586473 | 583 nt | TSL 2 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | HTN1-205 | ENST00000610341 | 536 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | IGKV1D-33-202 | ENST00000611734 | 324 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC068506.1-202 | ENST00000613388 | 545 nt | TSL 3 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MTND4P27-201 | ENST00000450813 | 1354 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | SAGE1-201 | ENST00000324447 | 2952 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | LEPR-202 | ENST00000349533 | 8227 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | OR5K1-202 | ENST00000642057 | 3466 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | ANKRD36C-201 | ENST00000295246 | 2272 nt | TSL 5 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | CEP57L1-201 | ENST00000359793 | 2515 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | C1orf141-202 | ENST00000371006 | 2053 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | DEFB108F-201 | ENST00000344638 | 222 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNA5SP99-201 | ENST00000364020 | 114 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Y_RNA.315-201 | ENST00000365117 | 102 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Y_RNA.387-201 | ENST00000383918 | 102 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MIR592-201 | ENST00000384959 | 97 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | CISD1P1-201 | ENST00000393907 | 327 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL591034.1-201 | ENST00000407447 | 340 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
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| CCDC6 | Q16204 | LINC01344-201 | ENST00000420760 | 261 nt | TSL 3 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL590632.1-201 | ENST00000424289 | 371 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | UBE2D3P2-201 | ENST00000424409 | 445 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC069257.1-202 | ENST00000425275 | 422 nt | TSL 3 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MED13P1-201 | ENST00000428342 | 171 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MTND4P19-201 | ENST00000446659 | 478 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | SCARNA18-201 | ENST00000459004 | 134 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNA5SP310-201 | ENST00000459084 | 116 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RPL37P6-201 | ENST00000460682 | 294 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
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| CCDC6 | Q16204 | FAM206BP-201 | ENST00000510179 | 541 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNA5SP471-201 | ENST00000516971 | 106 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | APOOP3-201 | ENST00000536787 | 586 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MIR4790-201 | ENST00000577799 | 79 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL589765.7-201 | ENST00000601684 | 629 nt | TSL 3 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL356575.1-201 | ENST00000603008 | 283 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC113139.1-201 | ENST00000605049 | 239 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC022893.3-201 | ENST00000607665 | 437 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC005014.2-201 | ENST00000607795 | 599 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC080100.1-201 | ENST00000624239 | 5356 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | SAMD9L-201 | ENST00000318238 | 7134 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | TSGA10-205 | ENST00000410001 | 3036 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MGAT4C-210 | ENST00000620241 | 3194 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | ATP11C-201 | ENST00000327569 | 6115 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | PLSCR5-201 | ENST00000443512 | 1969 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL050331.3-201 | ENST00000448740 | 2081 nt | TSL 2 BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | UBE2L2-201 | ENST00000254302 | 429 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-859P-201 | ENST00000362728 | 107 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Y_RNA.166-201 | ENST00000363730 | 102 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MIR514A2-201 | ENST00000385131 | 88 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MIR514A3-201 | ENST00000385132 | 88 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MIR559-201 | ENST00000385188 | 96 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-550P-201 | ENST00000391057 | 101 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU1-101P-201 | ENST00000391171 | 127 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-193P-201 | ENST00000410977 | 107 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | OR6C66P-201 | ENST00000414917 | 930 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | ACTR3BP6-201 | ENST00000422332 | 1241 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC005062.1-206 | ENST00000424516 | 710 nt | TSL 3 BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL137789.1-201 | ENST00000439443 | 682 nt | TSL 3 BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC004691.1-201 | ENST00000440376 | 547 nt | TSL 3 BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MTCYBP6-201 | ENST00000441810 | 138 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL441989.1-201 | ENST00000454204 | 382 nt | TSL 3 BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MTCO3P10-201 | ENST00000455912 | 772 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC103975.1-201 | ENST00000482506 | 483 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | SNORA9.3-201 | ENST00000516383 | 129 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNA5SP148-201 | ENST00000516527 | 94 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-1046P-201 | ENST00000516538 | 107 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Y_RNA.718-201 | ENST00000517110 | 102 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | NCRNA00250-201 | ENST00000519500 | 519 nt | TSL 4 BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MAL2-206 | ENST00000522187 | 547 nt | TSL 4 BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AP006587.4-201 | ENST00000526053 | 529 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC011611.2-201 | ENST00000549888 | 358 nt | TSL 3 BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC015712.3-201 | ENST00000559380 | 164 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC026462.3-202 | ENST00000564361 | 515 nt | TSL 3 BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MIR3672-201 | ENST00000584290 | 82 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | BNIP3P25-201 | ENST00000596023 | 559 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC090115.4-201 | ENST00000609970 | 188 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MIR6817-201 | ENST00000615588 | 66 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | SEPT14P19-202 | ENST00000632397 | 370 nt | TSL 3 BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MAPK10-322 | ENST00000641485 | 4530 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | LRRC6-212 | ENST00000618342 | 1754 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | OR2J3-203 | ENST00000641960 | 3342 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | ZNF334-205 | ENST00000615481 | 3706 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | LRRC49-224 | ENST00000560691 | 2531 nt | TSL 2 BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | ANKRD18EP-201 | ENST00000405487 | 2632 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNA5SP68-201 | ENST00000363885 | 119 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-1303P-201 | ENST00000364841 | 107 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | SNORA9.2-201 | ENST00000365361 | 133 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Y_RNA.414-201 | ENST00000384011 | 101 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Y_RNA.445-201 | ENST00000384168 | 102 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Y_RNA.459-201 | ENST00000384251 | 102 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-306P-201 | ENST00000384617 | 107 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |