Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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