Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
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