Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIP4Q15650 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms