Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC3Q15034 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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