Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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SHPRHQ149N8 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC0.23□□□□□ -2.37
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SHPRHQ149N8 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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SHPRHQ149N8 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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SHPRHQ149N8 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SHPRHQ149N8 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
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SHPRHQ149N8 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
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SHPRHQ149N8 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
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SHPRHQ149N8 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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SHPRHQ149N8 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
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SHPRHQ149N8 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
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SHPRHQ149N8 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
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