Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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GPNMBQ14956 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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GPNMBQ14956 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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GPNMBQ14956 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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GPNMBQ14956 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GPNMBQ14956 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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