Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CTTNQ14247 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms