Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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