Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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