Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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