Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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CNTN1Q12860 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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