Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms