Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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