Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SFT2D2O95562 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SFT2D2O95562 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SFT2D2O95562 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SFT2D2O95562 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SFT2D2O95562 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SFT2D2O95562 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
SFT2D2O95562 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SFT2D2O95562 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SFT2D2O95562 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
SFT2D2O95562 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SFT2D2O95562 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
SFT2D2O95562 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SFT2D2O95562 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
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