Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTIFO43310 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTIFO43310 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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