Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
J3KRW8 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
J3KRW8 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
J3KRW8 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.57□□□□□ -2
J3KRW8 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
J3KRW8 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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