Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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LHX9Q9NQ69 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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LHX9Q9NQ69 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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LHX9Q9NQ69 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
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LHX9Q9NQ69 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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LHX9Q9NQ69 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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LHX9Q9NQ69 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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LHX9Q9NQ69 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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LHX9Q9NQ69 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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