Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
FAM3DQ96BQ1 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms