Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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