Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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KNOP1Q1ED39 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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KNOP1Q1ED39 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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KNOP1Q1ED39 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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