Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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