Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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