Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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