Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
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