Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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