Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
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ALX1Q15699 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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ALX1Q15699 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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ALX1Q15699 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
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ALX1Q15699 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
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ALX1Q15699 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
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ALX1Q15699 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
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ALX1Q15699 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALX1Q15699 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
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