Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SS18Q15532 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SS18Q15532 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms