Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms